公司是否负责需视情况而定。依据《劳动合同法》，若员工因过错致公司损失，公司可解除劳动关系。若员工玩忽职守或盗窃，需承担相应责任，否则公司或需担责。严重情况下，若不及时处理，可能导致公司财产损失无法追回，影响公司正常运营。
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视情况处理。员工有过错（如玩忽职守、盗窃）时，公司可解除劳动关系并依法追责；若员工无过错，公司应：1.立即报警，配合警方调查；2.加强公司内部安保措施，防止类似事件再次发生；3.评估财产损失，考虑是否需要向保险公司报案理赔。
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处理方式需根据具体情况选择。若员工有过错，公司可依据《劳动合同法》解除劳动关系并追责；若无过错，公司应考虑加强安保措施。选择处理方式时，应综合考虑员工职责、过错程度及公司利益。