需了解扣烟原因，依据法律规定处理。分析说明：当烟草公司在中转厂扣下一百多条烟时，首先应了解扣押的具体原因，是否涉及非法运输、无证销售或烟草制品存在质量问题等。根据《中华人民共和国烟草专卖法》及相关法规，烟草制品的运输和销售需严格遵守法律规定，无准运证或销售假、私、非烟等行为将受到法律制裁。若确实存在违法行为，应及时采取措施纠正，并配合相关部门的调查处理。提醒：若烟草公司长时间未给出明确处理意见或扣押行为涉嫌违法，表明问题比较严重，应及时寻求专业律师的帮助，维护自身合法权益。
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常见处理方式：从法律角度讲，处理被扣烟草制品的常见方式包括了解扣押原因、申请行政复议或提起行政诉讼、寻求和解或调解等。选择建议：-若对扣押原因无异议，可积极与烟草公司沟通，了解后续处理流程。-若对扣押行为或处理结果有异议，可申请行政复议或提起行政诉讼，维护自身合法权益。-同时，也可考虑寻求和解或调解，以更高效、便捷的方式解决问题。
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在不同情况下的具体操作：1.若扣押原因为无准运证或超量运输，应立即补办相关手续，并缴纳可能产生的罚款。同时，与烟草公司沟通，了解后续处理流程。2.若扣押的烟草制品被认定为假冒、伪劣或走私产品，应积极配合相关部门的调查处理，并依法接受处罚。对于被没收的烟草制品，无权要求返还。3.若认为扣押行为或处理结果存在违法之处，可收集相关证据，向烟草专卖行政主管部门申请行政复议，或直接向人民法院提起行政诉讼。在复议或诉讼过程中，应充分阐述自己的观点和理由，并提供有力证据支持。4.在整个处理过程中，应保持冷静、理性，避免采取过激行为。同时，积极寻求专业律师的帮助，以确保自身权益得到充分保障。