车主不配合交强险垫付，可依法处理。根据《机动车交通事故责任强制保险条例》等，不配合可能导致无法及时获得赔偿，影响权益。建议及时保存证据，通过法律途径解决。
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车主不配合垫付，应：1. 保存好相关证据，如事故认定书、医疗单据等；2. 检查保险合同中是否有仲裁条款，有则准备仲裁材料；3. 若无仲裁条款，直接向法院提起诉讼，要求车主及保险公司履行垫付义务。
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车主不配合时，常见处理方式为申请仲裁或提起诉讼。若合同中有仲裁条款，则选择仲裁；若无，则向人民法院提起诉讼，以维护自身合法权益。